通量高
靈敏度高
不受物種限制
亞硫酸鹽轉化
PE150測序
《DNA methylation in mice is influenced by genetics as well as sex and life
胞嘧啶甲基化是哺乳動物最常見的DNA修飾形式。體細胞增殖過程中,,甲基化模式的維持是親子代細胞表觀遺傳的基礎,。而在生殖細胞和胚胎早期發(fā)育過程中,DNA甲基化會發(fā)生大規(guī)模的重編程,。DNA甲基化對胚胎正常發(fā)育和等位基因的選擇表達至關重要,。有證據(jù)表明DNA甲基化模式在某種程度上受遺傳控制,暗示了子女和父母之間存在相似的甲基化模式,。
取材:
小鼠C57BL/6N 和C3H/HeN以及正反交F1后代,。
高通量測序:
全基因組甲基化測序,30-35X,。
生信分析:
全基因組甲基化水平分布趨勢分析,;差異性甲基化區(qū)域(DMRs)分析。
研究結果:
不同小鼠基因型C57BL/6N 和C3H/HeN的DNA甲基化差異位點有數(shù)千個,,并且這些差異位點在F1后代是保守的,。
比較不同性別小鼠的常染色體DNA甲基化模式,發(fā)現(xiàn)數(shù)百個不同的甲基化區(qū)域,。
比較不同生活經(jīng)歷(妊娠史)的小鼠,,發(fā)現(xiàn)CpG甲基化模式僅限于有后代的雌性小鼠。
圖2. DNA甲基化模式在F1后代的親本等位基因上重演,。
這些結果證明了跨代CpG甲基化的穩(wěn)定性,,表明了CpG甲基化可能是生物體內(nèi)對生命事件的表觀遺傳記錄。
參考文獻:
Grimm S, Shimbo T, Takaku M, et al. DNA methylation in mice is influenced by genetics as well as sex and life experience. Nature Communications. 2019, 10: 305, https://doi.org/10.1038/s41467-018-08067-z.