精品人妻中文字幕在线,国产av激情一区二区三区,1024在线看

mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組測序

產(chǎn)品名稱及編號：YMFW-101

◇ 產(chǎn)品介紹 ◇

轉(zhuǎn)錄組代表細(xì)胞或組織內(nèi)全部的RNA轉(zhuǎn)錄本,，反映不同生命階段,、不同組織類型、不同生理狀態(tài)以及不同環(huán)境條件下表達(dá)的基因,。
轉(zhuǎn)錄組研究可以從整體水平上反映細(xì)胞中基因表達(dá)情況及其調(diào)控規(guī)律,，揭示特定生物學(xué)過程以及疾病發(fā)生過程中的分子機(jī)理,。
轉(zhuǎn)錄組測序即RNA-seq是最近發(fā)展起來的基于新一代測序進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析的技術(shù)。
RNA-seq技術(shù)具有通量高,、靈敏度高及不受物種限制等優(yōu)點(diǎn),，通過RNA-seq可以獲得RNA的表達(dá)量, 發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本等，
目前已廣泛應(yīng)用于生物學(xué)研究,、醫(yī)學(xué)研究,、臨床研究和藥物研發(fā)等領(lǐng)域,。

通量高

靈敏度高

不受物種限制

◇ 技術(shù)路線 ◇

圖1.轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)路線

◇ 樣品要求 ◇

◇ 文庫構(gòu)建策略 ◇

polyA富集mRNA

PE150測序

◇ 生物信息 ◇

◇ 項(xiàng)目運(yùn)轉(zhuǎn)周期 ◇

樣品質(zhì)檢合格開始計(jì)算，完成標(biāo)準(zhǔn)分析約30工作日,。

◇ 案例解析 ◇

《三陰性乳腺癌的基因組和轉(zhuǎn)錄組：亞型和治療策略》

期刊名稱：Cancer Cell
影響因子：22.844
發(fā)表年份：2019.03

研究背景：

三陰性乳腺癌是乳腺癌中惡性程度最高的一種,，并且目前三陰性乳腺癌只能依靠化療，并且治療效果不佳,，這是乳腺癌學(xué)界的一道世界性難題。越來越多的研究表明,，三陰性乳腺癌可能并不是單一的類型,，其有哪些亞型，在此前國際上所有的三陰性乳腺癌研究課題中都沒有給出明確的答案,。本研究旨在獲得三陰性乳腺癌的基因圖譜,，進(jìn)行分子分型，為精準(zhǔn)治療提供參考,。

研究方法：

樣本材料：360個(gè)三陰性乳腺癌腫瘤組織樣本
高通量測序：去除核糖體RNA測序,，Illumina HiSeq平臺
生信分析：無監(jiān)督聚類分析；基因富集分析等,。

研究結(jié)果：

使用無監(jiān)督的k均值聚類方法將360個(gè)腫瘤分為4個(gè)獨(dú)立的亞型：免疫調(diào)節(jié)型（IM）,、腔面雄激素受體型（LAR）、基底樣免疫抑制型（BLIS）,、間質(zhì)型（MES）,。

圖2 mRNA亞型的表達(dá)熱圖

基于mRNA的TNBC的亞型分類對TCGA數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，與TCGA的TNBC患者相比,，中國患者的LAR亞型患病率較高（23%）,。

圖3 中國和TCGA中的三陰性乳腺癌的mRNA亞型的分布

將4種mRNA亞型結(jié)合淋巴結(jié)狀態(tài)和腫瘤大小進(jìn)行預(yù)后分析，結(jié)果顯示IM相對于BLIS有明顯更好的預(yù)后（風(fēng)險(xiǎn)比：0.34; 95％置信區(qū)間：0.13-0.85; p = 0.021）,。

圖4 中國和TCGA中的三陰性乳腺癌的mRNA亞型的分布

研究結(jié)論：

中國三陰性乳腺癌分為4種類型,，IM、LAR,、BLIS,、MES。這是國際上首次基于多維大數(shù)據(jù)系統(tǒng)提出的三陰性乳腺癌分類標(biāo)準(zhǔn),，這為尋找到三陰性乳腺癌的靶點(diǎn)指明了新的方向,。

參考文獻(xiàn)：

Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Quis ipsum suspendisse ultrices gravida. Risus commodo viverra maecenas accumsan lacus vel facilisis.